Sau khi nhận được thông tin từ một nguồn đáng tin cậy tại California, Thiếu tá Kusanagi Motoko và đội nhận ra rằng mối đe dọa hậu nhân ngày càng trở nên nghiêm trọng và không thể chối cãi. Với tâm tình quyết tâm, họ quyết định quay trở lại Tokyo để đối mặt với những thách thức mới và cùng nhau tìm ra giải pháp cho vấn đề đang ngày càng gia tăng.